Manchmal Das Gleichgewicht kann durch verschiedene Krankheiten und falsche Lebensgewohnheiten durcheinander gebracht werden:

• quantitativ falsche Ernährung (zum Beispiel zu viel Zucker oder zu viel Eiweiß)
• einseitige und unausgewogene Ernährung (zum Beispiel einseitige Diät)
• zu viele leicht verdauliche Kohlenhydrate
• schlechtes Kauen
• dauerhafter Stress
• Medikamente (zum Beispiel Antibiotika)
• Abführmittel
• Magen-Darm-Erkrankungen, Infektionen (zum Beispiel Virusinfektionen)

Es ist sinnvoll, vom Arzt oder Heilpraktiker eine Stuhlprobe an ein naturheilkundlich arbeitendes Labor schicken zu lassen. Dort kann bestimmt werden, ob die gefundenen Bakterien der Anzahl und Art der gesunden Darmflora entsprechen. Es wird aber auch ermittelt, in welchem Maße gesundheitsschädliche Bewohner wie schädliche Bakterien oder Pilze vorhanden sind. Teilweise werden auch Empfehlungen zur Darmsanierung und Ernährung gegeben.